Změna portu se provádí přes SQL Server configuration manager. V menu v položce Protocols for MSSQLSERVER se zvolí vlastnosti TCP/IP. A dále podle potřeby pro dané IP adresy navázané na server se upraví TCP Port. Stačí 127.0.0.1, vnitřní IP a vnější IP. Pro každou se dá nastavit jiný port, popř. vytvořit alias.
V Management studiu se potom port nedefinuje přes dvojtečku, ale přes IP,port. Např. 192.168.2.2,12345. Pokud se přistupuje k instanci nebo aliasu, tak potom např. přes 192.168.2.2\alias,12345.
Pro connection string poté platí zápis tcp:<servername>[\<instancename>],<port> nebo tcp:<IPAddress>[\<instancename>],<port> viz dokumentace